2010个新闻

在约翰·西蒙·古根海姆基金会已任命 哈门·布斯玛克,副教授生物科学的哥伦比亚的部门,作为其2010名研究员之一。该奖项支持题为其中博士“破译基因表达调控的语言”一期工程。 bussemaker将结合从生物物理学和遗传学方法,以预测的基因调控网络的行为,并测试使用湿实验室实验这些预测。古根海姆研究员任命了不起的成就在未来辉煌过去和卓越的承诺的基础上。 点击这里 了解更多。

转录网络的脑肿瘤间质转变

高级别胶质瘤的间充质签名由六个转录因子控制。参与MGES目标激活TFS以粉红色显示,那些参与镇压是紫色。

高级别胶质瘤,如成胶质细胞瘤,是无法治愈的,部分原因是肿瘤细胞在整个大脑广泛传播。此能力侵袭性生长已经与基因在间充质细胞更通常转录的表达相关联。 在工作发表在Nature杂志上安东尼奥iavarone,安德烈卡利法诺,和他的同事已经确定了一个小型的转录因子的网络,是负责神经胶质瘤细胞的间充质行为。

作者施加的特定的算法设计为从高级别胶质瘤样本176因果推断的转录因子靶相互作用以基因表达谱。他们分析了一种新的算法,使他们从高级别胶质瘤先前确定的间充质基因表达签名来评价转录因子网络所产生的相互作用组。这鉴定了具有调节的间充质基因表达相关的53个转录因子。进一步分析鉴定信号转导和转录因子3(STAT3)和caatt /增强子结合蛋白β(cebpβ)作为潜在的主调节器控制这些间充质的基因的一个相当大的比例的表达的激活剂。作者的结论是系统生物学的方法可用于鉴定参与恶性转化,这种方法可应用于帮助解剖其它肿瘤表型的复杂性主转录因子。