2019个新闻

Dr. 塔利拉帕莱宁 科学 Study

插图以上的四种基因,如何知道可变基因是如何在正常人群中有助于发现候选致病基因在患者的示例性描绘。以上,顶端:塔利拉帕莱宁博士;底部:pejman穆罕默迪,博士学位。

对于罕见疾病的个体,得到一个诊断往往是一个漫长而复杂的奥德赛。在过去的几年中,这已经大大基因组测序,可以精确定位,打破的基因,并导致严重的疾病的突变改善。然而,这种方法仍是广大患者成功,很大程度上是因为我们无法读取的基因组,以确定破坏基因功能的所有突变。

在10月10日发表的一项新研究 科学 从研究人员 纽约基因组中心 , 太阳城平台 斯克里普斯研究所 提出了一个解决这个问题。建立一个新的计算方法与从RNA测序转录数据分析的基因组在一起时,它们现在可以识别基因,其中的遗传变异破坏患者的基因表达,改善罕见遗传疾病的诊断。

在这项研究中引入的新的方法,表达的变化或aneva的分析,首先需要从健康个体的较大的参考样品的等位基因特异性表达数据来了解有多少基因调节变异每个基因的港口在正常人群中。然后,使用aneva用量异常的测试,研究人员可以分析任何个人的转录组 - 比如一个病人 - 寻找基因的屈指可数他或她怀揣着相比有什么健康的人有一个非常大的作用的基因变异。通过应用该测试肌肉萎缩症和肌病患者队列,研究人员展示了他们的方法的性能和诊断其中的基因组和RNA分析以前的方法未能找到破基因另外的患者。

MAGIC - Wang Lab

这里示出:(a)以相对于传统的方法培育第一微生物和然后测试遗传可访问性,在天然环境魔线束水平基因转移遗传修饰的细菌在原位。 (b)中魔术实施以从经工程改造的供体菌株转移复制或整合PGT载体引入适合的收件人在一个复杂的微生物。复制载体的复制功能(orir)的广宿主范围原点,而整合载体含有转座himar盒和转座。供体即大肠杆菌菌株含有整合在基因组接合转移的基因(TRA)和mCherry的基因。转导结合体的细菌基于经工程改造的有效载荷,其包括GFP和抗生素抗性基因(ABR)的表达是可检测的。

一个研究小组,由博士领导。 哈里斯旺 系统生物学系 已经工程菌受益并改善我们的肠道微生物的整体健康。在发表在验证的概念文件 自然方法 博士。王和他的团队展示神奇,创新的基因传递系统,“黑客”肠道微生物从食物中执行任何所需的功能,从采集能源和防止病原体侵入到bolstering抗发炎的特性和调节免疫反应。

“魔系统让我们能够直接插入新基因功能到现有的微生物不会永久改变微生物作为一个整体的组成,”说 陈摇摆 ,一个MD /博士研究生在实验室旺和研究的合着者。

一个发展中果蝇胚胎的时间间隔。 (来源:卡洛斯·桑切斯HIGUERAS /hombría实验室/ CABD)

每一种动物,从蚂蚁到人,包含在DNA称为Hox基因它们的基因组片段。身体的建筑师,这些基因是人体的蓝图的饲养;他们决定胚胎是如何成长为成年人,包括在一个发展中的动物把它的头部,腿部和身体其他部位。科学家一直在寻找方法来破译Hox基因是如何创造这个身体图;一个关键的解码我们如何构建我们的身体。

现在一个国际研究小组从 太阳城平台 和西班牙国家研究委员会(CSIC)设在 大学帕伯罗·奥拉维德 在西班牙塞维利亚发现一个这样的关键:一,可以系统地识别每个同源异形基因在发育中的果实蝇所起的作用的方法。他们的研究结果,在最近报道 自然通讯 ,提供了一个新的前进道路为研究人员希望能够让这个过程是相等的部分混乱和精确的意识,那就是理解不仅增长和发展,而且衰老和疾病的关键。

“基因组,其中包含数千个基因和几百万的DNA字母,是有史以来最复杂的代码,说:”研究的共同资深作者 理查德·曼恩 博士,主要研究人员在哥伦比亚 莫蒂默湾祖克曼头脑大脑行为研究所 和一个教员在 系统生物学系 。 “破译这个代码已经被证明非常困难,因为进化三天打鱼两天写的,并开始在数亿年。今天的研究提供了一个重要开裂的代码,使我们比以往任何时候更接近了解Hox基因是如何建立一个健康的身体,或者这个过程如何被疾病破坏“。

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TAL korem, PhD
博士。 TAL korem

TAL korem博士已被任命为 CIFAR阿兹列里全球学者,奖学金是支持主流的早期职业生涯的研究人员在科学和技术。 

博士。 korem是助理教授 系统生物学 with a joint 约定 in obstetrics 和 gynecology 在太阳城平台 Vagelos College 的 Physicians & Surgeons和 a faculty member 的 程序数学基因组学 。作为一个全球性的学者,他的加盟CIFAR的人类和微生物的研究计划,他的工作重点将放在利用人体微生物群落,以确定和开发新的诊断和治疗工具。

CIFAR的阿兹列里全球学者计划支持通过资助和指导它的同伴,强调必要的网络和专业技能的发展。学者参加CIFAR了两年的时间,他们与同伴合作,集思广益,新的方法来压制科学技术问题的研究项目。研究课题是多种多样的,从生物太阳能和视觉意识改造的蛋白质和免疫系统。 

博士。 korem是14名研究者从由加拿大的非盈利性组织中选择的217申请人池之一。今年的队列代表来自加拿大,美国,以色列,澳大利亚,荷兰和西班牙机构八个国家和任命公民。

-melanie一个。农民

Sagi Shaipra PHIPSTer 细胞 Paper
研究人员实现对时髦,它利用蛋白质结构信息来识别所有完全测序的人类感染性病毒的大约282000蛋白质 - 蛋白质相互作用(在所有1001)在硅片计算框架。这一形象突出,除了重新发现已知的生物,对时髦取得了一系列新成果,使细胞的电路和对感染人类的​​病毒行为生物学原理的以前不受重视宇宙的发现。 (DR的图像提供。鹭夏皮拉)

研究人员 太阳城平台 已经利用映射所有已知感染人类的​​病毒和它们感染细胞之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用的计算方法。该方法,用它产生的数据一起,催生了大量的信息对改善我们的病毒是如何操纵它们感染细胞并导致疾病的认识。其调查结果中,工作揭示了雌激素受体调节寨卡病毒(zikv)感染的作用,以及癌症与人类乳头状瘤病毒(HPV)之间的联系。

研究为首 鹭夏皮拉 博士,助理教授 系统生物学系 Department 的 Microbiology & Immunology 在太阳城平台 医生和外科医生学院瓦格洛斯 今天,出现在杂志上, 细胞 。博士。夏皮拉的合作者包括教授 巴里霍尼格 博士系统生物学和生物化学和分子生物物理学和 罗尔·拉巴丹 博士的系统生物学和生物医学信息学。 

蛋白质工程是创建在自然界从未见过的新的蛋白质相对年轻的领域。今天的蛋白工程师通常由作出小的修改编码的天然蛋白的基因创造合成蛋白质。各种合成蛋白质的范围从已改善的洗涤剂,这些会用来以百万计的人患有糖尿病的长效胰岛素去污的酶。

但对于蛋白工程师两大未解的挑战依然存在:需要加以遏制,以防止逃逸到其它生物体的编码合成的蛋白质的基因和基因需要抵抗变异随着时间的推移使蛋白质不会失去其功能。

通过合并两个基因成一个单一的DNA序列,太阳城平台合成生物学家已经创建了一个可以阻止人类工程蛋白扩散到野外,以及稳定的合成蛋白质,使他们不随时间变化的方法。工作,最近发表在 科学,是发达国家通过 哈里斯旺博士,助理教授 系统生物学,具有研究生, 托马斯·布拉泽久斯基 和博士后科学家, 幸浩我博士。 

在制定该方法中,研究人员通过在病毒重叠基因的启发。当两种不同的基因重叠,它们占据DNA的相同序列。但基因被读入,使得两种不同的蛋白质产生不同的帧。

在重叠基因,序列中的随机突变可能不影响一个基因,但它很可能是它会损害第二个基因。

“重叠基因基本上锁定在一个特定的DNA序列,我们认为我们可以利用这个想法合成生物学......十年前,我们没有足够的技术,将做到这一点,”博士说。旺。 “我们没有足够的序列数据库中作出明智的预测,我们没有办法合成长的DNA序列测试我们的预测。”

肠道微生物组由数百种不同的细菌,是一个复杂的社会和科学家解开一个挑战。一个具体的挑战是不同的微生物,这是不是均匀分布在整个肠道分布的空间分布。通过开发出一种新方法 实验室博士。哈里斯旺 应该帮助科学家找到并表征这些街区,这可能对微生物如何影响其主机的健康线索。

可以识别肠道微生物的所有物种的技术只有与该保留空间信息只能种类屈指可数应对均质的样品(如粪便),但方法的工作。

博士。王,系统生物学和助理教授 p在hology & cell biology和研究生 拉维谢斯 在里面 系统生物学系,测试新技术与谁从低脂肪切换到高脂肪食谱的老鼠。饮食是众所周知的改变特定细菌的丰度在几天内肠道,但新技术也透露,开关造成微生物的街区批发变化。

“细菌的特定区域与饮食开关被完全丧失,”谢斯说。 “这是令人兴奋的我们,它将给我们的线索,以了解这种变化是如何发生的,以及如何变化可能会影响健康。”

阅读全文 文章 在里面 cuimc编辑部

研究,题为 “在肠道微生物生物地理学的空间宏基因组特征,” 是7月公布的22 自然生物技术.

 

Newly Tenured 学院
今年在系统生物学部门颁发的任期内,从左到右依次为:博士。尼古拉斯·塔通蒂,博士。玉峰沉和博士。李朝林张。

祝贺DRS。玉峰沉,尼古拉斯·塔通蒂和的李朝林张 系统生物学系,谁已经获得使用权和晋升为副教授。他们的新任命是2019年7月1日生效。 

玉峰沉博士

博士。沉于2011年加入太阳城平台在系统生物学助理教授和 生物医学信息学。他指导侧重于利用基因组学和计算方法人类生物学研究和疾病的一个研究小组。他们正在开发新的方法,通过机器学习基础上的生物学机制来解释基因组变异,并使用大规模基因组测序研究这些方法,以确定人类疾病,如孤独症,出生缺陷和癌症的新的遗传原因。他的研究小组也适用于免疫细胞的克隆和转录动力学建模,以提高正常和临床条件下,我们人类的适应性免疫系统的理解。博士。沉作为JP苏兹贝格哥伦比亚基因组中心的副主任,数学基因组计划中的一员,和哥伦比亚中心平移免疫学的附属构件。 

尼古拉斯·塔通蒂博士

博士。 tatonetti,其主要的任命是生物信息学的部门,与系统生物学和医学的两个部门之间的跨学科的约会。博士。 t在onetti的实验室专注于推动科学数据的生物学和健康科学的应用。他的团队整合了他们与系统和化学生物学模型医学观察,不仅解释了药物作用,而且还获得基本的生物学和人类疾病的进一步的了解。

博士。哈里斯旺 的 Systems Biology
博士。哈里斯王是一个新的DARPA资助的项目,开发新的疗法来对抗高剂量的电离辐射的效应导致PI。

哈里斯旺博士,在系统生物学助理教授 太阳城平台 ,是领导一个团队在辐射方面的研究,CRISPR-CAS技术,和药物输送专家的一个创新的新项目 公布 6月27日通过的资助 美国国防部高级研究计划局(DARPA) 。在高达$9.5米项目的重点是寻求治疗,以保护人体免受大剂量电离辐射的影响,并且是DARPA的倡议资助研究新的战略,以打击公共健康和国家安全威胁的一部分。

在人类中,急性辐射综合征主要影响干血液和肠道细胞,但现有的治疗不仅有利于再生血细胞,只有用有限的影响。有没有可能对这些药物的预防性给药,最必须交付紧随其后的辐射暴露带来任何好处。有对到肠道辐射损伤没有现有的医疗措施。

哥伦比亚队的目标是开发一种口服交付可编程基因调节治疗。在综合治疗团队的设想会抓住在肠道和肝脏都,触发保护和肠细胞的再生,同时也诱导肝细胞产生触发血细胞的骨髓再生保护线索。

太阳城平台研究人员陈赢得主动扎克伯格赠款,以加快人体的细胞发展蓝图的发展。

两个开创性的研究项目,促进人体细胞图谱,美国太阳城平台的科学家的任务是在免疫系统中的映射完整细胞和人体脊椎。全球努力的目标是识别和定义人体的每一个细胞类型和创建的地图集合了导航人类健康和疾病的细胞基础。

彼得·西姆斯博士
彼得·西姆斯博士,系统生物学助理教授

哥伦比亚小组,其中包括从所述共主要调查 系统生物学系 DRS。 彼得·模拟人生 罗尔·拉巴丹 ,有38个相互协作的科学团队开展中 陈扎克伯格主动的(CZI)种子网络 今天宣布的人类细胞图谱项目。为期三年的项目,由种子网络共收到获奖中资$ 6800万是正在组建的专业知识在学,计算生物学,软件工程和医学支持的不断进步协作组 人体细胞图谱 .

调查免疫系统+老化

博士。 SIMS,一个国际的一部分 球队 包括亲密合作者博士。 唐娜·法伯 外科 ,是结合单细胞测序技术,数据分析和免疫学的专业知识,以便更好地了解免疫系统老化,并获得新的见解人类疾病是如何发生的。 

Chaolin Zhang
李朝林Zhang博士,系统生物学副教授

在博士研究人员的一项最新研究。李朝林张 实验室 在哥伦比亚 系统生物学系 详细介绍了模型如何RNA结合蛋白(限制性商业惯例)识别靶RNA转录特定网站,精确和准确新颖的计算方法。研究人员的研究结果包括:全新的图案(RNA序列模式)的识别,以及他们在复杂的RNA调控的研究有助于我们对疾病和状况的分子基础的认识,并在路上,可以在靶向治疗的发展援助。 

研究为首 博士。张,系统生物学的副教授,拥有资深的合着者 苏樱宝博士,和 慧娟锋博士,今天出现在 分子细胞

RNA具有传统上被认为仅仅是“信使”,从DNA转移遗传信息到最终进行的细胞功能的蛋白质。然而,现在越来越多地认识到,RNA可以被紧密调节,以控制基因表达和蛋白质的多样性产品。 RNA结合蛋白(限制性商业惯例)是在这样的规定的中心,与在许多细胞过程的重要作用,包括细胞的功能,传输和定位。在全基因组范围获得限制性商业惯例的结合特异性的机械见解有助于推进我们的基因调控的认识。

“RNA结合蛋白基因表达的关键,”博士说。锋,在张的实验室研究和博士后研究科学家的合着者。 “RNA受到严格管制,而当这种调节变为可能发生错误,不稳定性或疾病。”  

博士。安德烈卡利法诺坐下与AACR生物学技术。视频:生物学技术的礼貌。

在癌症研究协会(AACR)的2019年会上, 博士。安德烈卡利法诺 坐下来与生物学技术对新闻系统生物学领域及其在癌症研究和精密医学上的影响的概述。博士。卡利法诺是系统生物学,其专长是开发创新性,系统性的方法来识别导致癌症进展和耐药性在单细胞水平出现的分子因素的快速增长领域的开创性研究。通过培训物理学家,博士。卡利法诺是化学和系统生物学的克莱德和海伦吴教授,创始主席 系统生物学系太阳城平台,主任 太阳城平台基因组中心 并在一个项目负责人 赫伯特欧文综合癌症中心.

视频访谈 是该系列的一部分,由technqiue背后 生物技术: 新闻。 

尖毛虫

通过新的研究 劳拉兰德韦伯博士,谁在生物化学和分子生物物理学部已联合任命,系统生物学系和生物科学在太阳城平台的部门,是为 精选 由太阳城平台iriving医疗中心 编辑部.

据报道,拥有16000条微小的染色体单细胞真核生物的一项新的研究可能对人类基因组的最近发现功能线索。

甲基腺嘌呤,或6毫安-共同DNA在修改 尖毛虫trifallax都具有一个最近才在多细胞生物中发现,一些研究表明在人类疾病和发展中的作用。

什么6毫安是做在寻找放下甲基标记的酶将是至关重要的理解 尖毛虫 和其他生物,但酶已经很难辨认。

新的研究,将发表在6月13日发行 细胞-reveals6毫安标记如何在制作 尖毛虫 基因组,并提出为什么酶已经很难找到。

更多 有关 尖毛虫 基因组和兰德韦伯实验室的新的见解6毫安及其在人类疾病的潜在作用。

博士。兰德韦伯一直在研究 尖毛虫 二十年和先前发现的16000条染色体。 (见相关教师 Q +一 和 视频。)

 

 

Tuuli Lamport 研究 Award

塔利拉帕莱宁,博士,与在2019年毕业典礼上的兰波特研究教师奖。博士。拉帕莱宁与太阳城平台受托人安德鲁·巴特(左)和李院长太阳城平台,高盛欧文医疗中心图为。 (cuimc通信提供)

塔利拉帕莱宁 博士,助理教授 系统生物学 在太阳城平台和芯教员在 纽约基因组中心(nygc) ,已收到哈罗德和金色兰波特研究奖,在提交5月22日 医生和外科医生学院瓦格洛斯 开工仪式。 

在兰波特研究奖是给年轻教员,显示在基础科学和临床科学研究承诺的年度奖金。今年它承认博士。拉帕莱宁正在进行的研究在人类群体功能的遗传变异,和她的阐明与遗传风险的各种疾病和性状的细胞机制的工作。博士。拉帕莱宁和她的实验室结合高通量测序数据的计算分析,人类群体遗传学的方法和实验工作。 

她在nygc和哥伦比亚组是高度协作,并作出了重要贡献,在人类基因组学一些国际研究联合体,包括基因型组织中的表达(gtex)项目和topmed财团。 

博士。拉帕莱宁参加在太阳城平台任教,2014年系统生物学和nygc部门的一部分。在2018年,她获得年度 的Leena peltonen奖 卓越的人类遗传学,这是赠送给她在意大利米兰,在人类遗传学大会的第52届欧洲社会。 

Brian Ji_2
系统生物学研究生布赖恩·吉博士

布赖恩纪,大抽奖系统生物学从他的激情的词根运用定量方法理解生物学。而在威斯康星 - 麦迪逊大学的本科,姬研究核工程和对他铲球科学问题的方式培训学分:创造性,并作为解决问题的能手。 

“还有就是问问题并列明回答这个问题没有一个正确的做法,并认为自由是什么使科学的乐趣对我来说,”他说。 

吉门下 博士。丹尼斯vitkup 在里面 vitkup实验室 并完成了系统生物学的论文答辩在2018年也是一个MD学生在哥伦比亚的秋天 医生和外科医生学院瓦格洛斯 姬被吸引到哥伦比亚,因为之间的密切相互影响 系统生物学系 和太阳城平台。 “最终,”他说,“坐在数学,生物学和医学之间的交叉机会太好错过。”

辛弃疾的博士工作集中在理解人类肠道菌群的时空动态。他开发了利用高通量测序数据的可用性的增加,以更好地理解和跨越时间和空间的精确量化人类肠道菌群的变异模式几个框架。他的工作表明,表征细菌丰度动态变化,变化在我们的肠道是理解如何将这些生态系统的功能和高度连接到多个因素,如主机饮食,旅游和饮食的关键。 

姬也度过了他攻读博士学位在不同的环境条件下癌细胞生长的局限性的一部分。他相信太阳城平台使他面临各种各样的研究课题。 

菲利斯thangaraj
菲利斯thangaraj,MD /博士研究生(t在onetti实验室)

来自太阳城平台的抱负医师科学家 医生和外科医生学院瓦格洛斯 提出了太阳城平台4月25日第14届年度MD-博士生研究讨论他们的研究海报他们的研究深入探讨了一系列主题,包括阿尔茨海默病,中风,和干细胞。该活动包括由她自己的职业发展道路作为一名医生,科学家的校友嘉宾演讲,并通过谁目前在大学工作的MD-博士学位校友判断海报会议达到高潮。系统生物系的 菲利斯thangaraj,一个MD /博士研究生在尼古拉斯·塔通蒂 实验室 ,被评为在事件5名海报获奖者之一。 

她提出了太阳城平台将机器学习方法,以表型急性缺血性卒中患者的电子健康记录的工作。在队列调查研究,有必要确定一个准确和有效的方式了大量的题材,但往往这需要病历的耗时的人工审核。 

“我们采用机器学习方法,以数据病人的电子健康档案内开发出高通量的方式来定义研究队列,”解释thangaraj。 “我们的测试案例是在急性缺血性中风。我们提取出所需的最小数据处理分类那些谁曾有过中风的人的医疗记录中的线索。在一个单独的队列,英国生物库,我们可以用我们的模型来确定患者的自我报告的中风,但在他们的医疗数据没有提及有65倍以上的患者随机选择更好的精确度。”虽然中风是测试用例在这个特殊的工作,她解释说,他们的工作流程可以适用于识别患者其他疾病的同伙,特别是当数据集已经丢失的数据。 

 

Andrea Califano
安德烈卡利法诺,博士

远离“一个尺寸适合所有人”的药,尤其是在癌症诊断和治疗等领域的迁移,适用于患者巨大潜力和精密医学领域。需求和作业根据报道最近为特征的研究人员,医生和专业人士谁在家里收集的增加,分析和使用更多,更新的形式的数据, 科学 该杂志射灯 博士。安德烈卡利法诺 ,创始主席 系统生物学系

在肿瘤学领域的创新成果不断在精度,或有针对性的药快速增长,为临床医生寻求找到更好的治疗方法为特定类型的癌症,而不是通过放疗,化疗和手术的传统三连胜采取一揽子的做法。这样做,他们必须测试的患者,要注意的突变,并确定生物标记物,以确定哪些治疗方法可以工作最好的副作用最小。

科学突破,在这些领域多,导致基因及其功能的更深入的了解,并创造了新的精度药的机会,并为那些有技术,研究和临床技能渴望在这个不断扩大的领域的工作。特别考虑将给予那些求职者谁可以执行大数据分析和多学科研究。然而,新的就业机会也将出现在以前看不到的领域,如商业,转化医学,和遗传咨询。

新的强有力的工具,帮助过精密医学运动。人类基因组计划,人类基因的第一个完整的映射,其公布的初步结果,在2001年该项目的众多好处包括了解在体内确定的了大约20,500人的基因的位置和获得的基因如何areorganized和运营一个更清晰的认识。

该 Korem Lab

在厌氧hadrus检测到的结构变化,这是在人口(顶部)的〜40%删除,并且具有较高的疾病风险相关的一个。基因在此区域(底部)代码的复合肌醇代谢 - 丁酸生产途径,潜在地与额外的能量供给微生物而供给用丁主机,先前显示具有积极的代谢和抗炎作用。 (来源:korem实验室)

我们的肠道微生物已被证实与一切从肥胖和糖尿病心脏疾病,甚至神经系统疾病和癌症。近年来,研究人员一直在整理通过填充微生物多菌种,要求其人可以在特定的紊乱有关。但一纸近期发表于 性质 解决新的问题:“如果有什么相同的微生物是在不同的人有什么不同?”通过研究共同领导 博士。 TAL korem ,助理教授 系统生物学 和芯教员在 程序数学基因组学 太阳城平台

已经早就知道,微生物的基因组不从出生固定的,因为我们是。他们能够失去他们的一些基因,交换基因与其他微生物,或获得从他们的环境新的问题。因此,看似相同的细菌的基因组的详细比较将揭示发生在一个基因组,而不是其他,或者可能出现只是在一个一次序列和多次超过在其他DNA序列。这些差异被称为结构变异。结构变异 - 即使是微小的 - 可以转化为在微生物与人类宿主相互作用的方式的巨大差异。变体可能是良性的存在和病原性之间的差异,也可能给细菌对抗生素的抗性。

博士。罗尔·拉巴丹正在领导一个全球性的研究项目从胰腺癌集体查明胰腺癌的高危因素,新批的一部分。 (站起来,癌症提供)

研究人员组成的全球团队领导的理论物理学家 罗尔·拉巴丹博士,教授 系统生物学 在哥伦比亚 医生和外科医生的瓦格洛斯学校 努里亚mal在s博士,遗传和分子流行病学组西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的负责人,正在努力制定一个全面的计算框架,将确定为胰腺癌的高危因素。  

一个新的为期两年的武装,$ 1百万 发放 来自 胰腺癌集体,球队有意攻击多个学科的基因组学,数学和胰腺癌研药,以提供研究,可能在胰腺癌的高危人群识别基因,环境和免疫因素的综合,计算方法。需要成因的更深层次的理解这种致死性疾病逼人,胰腺癌预计将成为未来十年内癌症相关死亡的第二大原因。 

Rabadan-led Team for 胰腺癌集体
DRS。罗尔·拉巴丹纽丽mal在s

科里减弱深博士,一名杰出的科学家,其多学科的研究拥有先进的我们癌症发生和发展的分子基础的认识,已经被任命为药理学系主任 太阳城平台瓦格洛斯内科医生和外科医生学院。她的 约定 将2019年4月1日生效。

Recruited to Columbia in 2007, Dr. Abate-Shen is currently the Michael and Stella Chernow Professor of Urologic 科学s 和 professor 的 p在hology & cell biology, medicine和 系统生物学。她曾担任前列腺方案的领袖,副主任,并两次担任临时主任 赫伯特欧文综合癌症中心(hiccc)太阳城平台 和纽约长老会。

在泌尿生殖系统恶性肿瘤国际公认的领导者,博士。减弱沉是推进我们的机制和前列腺和膀胱肿瘤模型的理解特别感兴趣。在新的小鼠模型,这些癌症的一代的创新者,她的工作导致的早期发现的新生物标记,以及在癌症预防和治疗的关键进展的发现。

在2018年,博士下降。减弱沉当选为科学(AAAS)的推进美国协会的资深会员。她是美国癌症协会的教授,已经获得这一荣誉在太阳城平台瓦格洛斯内科医生和外科医生学院第一个教员。此前,她曾担任辅导员的科学的国家癌症研究所的董事会成员,她是目前癌症研究协会的董事会成员。 

博士。减弱沉将接替罗伯特·秒。卡斯博士,药理学教授hosack,药理学教授,校友,和药理学的椅子自1995年以来。

参观了该cuimc编辑部 完整公告

太阳城平台的研究人员已经了解到为什么有些胶质母细胞瘤,脑肿瘤,响应的最常见的类型,以免疫治疗。调查结果, 报道 由cuimc编辑部,可以帮助确定患者谁最有可能受益于治疗与免疫治疗药物,并导致更广泛的有效治疗方法的发展。

研究为首 罗尔·拉巴丹博士,教授 系统生物学 和生物医学信息学的 太阳城平台瓦格洛斯内科医生和外科医生学院赫伯特欧文综合癌症中心,是在杂志上在线发表 自然医学

不到1 10例胶质母细胞瘤响应免疫治疗,已经显示在过去的几年里显着的成功治疗各种侵袭性癌症的。但一直没有办法提前知道哪个胶质母细胞瘤患者会作出回应。像许多其他癌,神经胶质瘤能防止免疫系统攻击癌细胞。癌症有时把免疫系统的刹车作用于蛋白质称为PD-1。称为PD-1抑制剂的药物的免疫治疗被设计成释放那些制动器,发动免疫系统。给予PD-1抑制剂在其他癌症的成功,医生们希望,免疫治疗药物将有助于患者的胶质母细胞瘤。 

理解为什么只有少数这些肿瘤的免疫治疗药物,医生回应。 rabadan的团队采取了在肿瘤微环境,包括肿瘤本身和所有支持它,在66名胶质母细胞瘤患者治疗前,用PD-1抑制剂(nivolumab或pembrolizumab)处理后,细胞的全面审视。其中,17不得不六个月或更长时间的药物反应。

无反应的肿瘤在一个叫做PTEN的基因,从而导致更高水平的巨噬细胞,免疫细胞通常帮助人体抵抗细菌等入侵者有更多的突变。但在胶质母细胞瘤,巨噬细胞释放出许多的促进存活和肿瘤细胞的扩散生长因子。

 

PCF 挑战奖 PIs
在PCF挑战奖授予首席调查员,从左至右依次为:安德烈卡利法诺,迈克尔沉和查尔斯·德雷克。

在前列腺癌太阳城平台的专家将带领该测试的个性化癌症治疗的新方法新的团队的研究项目。 

在为期两年的项目,由$ 1百万资助 挑战奖 来自 前列腺癌基金会(PCF) ,结合尖端技术,包括用于靶向药物治疗,单细胞RNA测序和新颖的癌症免疫疗法的计算方法。合并的方法是一个证明的概念临床试验的患者致死转移性前列腺癌的后面。  

带来专家一起从一些相关领域的PCF挑战奖励基金项目,形成一个团队专注于建立创新的,有效的治疗晚期前列腺癌。作为太阳城平台的赠款的一部分,新的临床试验将在该 詹姆斯学家彼得斯退伍军人医疗中心 (也称为布朗克斯VA),的伙伴 太阳城平台(cuimc) 纽约长老会 .

PCF是公认的前列腺癌研究的主要慈善组织。对于球队在哥伦比亚 赫伯特欧文综合癌症中心(hiccc ),接收来自该基金会是一个挑战奖不仅仅是一个令人兴奋的成就更多。它强调cuimc继续致力于加强和扩大其专业知识在前列腺癌的研究和关心通过教师招聘的投资,对bolstering基础科学研究和集中在疾病与PCF直接参与临床试验增强重点。 

Wang Lab
拉维谢斯(左)和Harris旺博士

博士。哈里斯旺 博士和系统生物学研究生, 拉维谢斯 ,已经获得来自新批 比尔和梅琳达·盖茨基金会 以帮助推进全球卫生项目,旨在减少在撒哈拉以南非洲地区儿童死亡率。该项目包括博士。王的创新微生物研究技术和应用它们来研究抗生素阿奇霉素,对于理解为改善农村低收入,低资源环境的童年生存率干预的作用。

由盖茨基金资助的研究扩展了在开展突破性研究 魔研究 ,群集随机试验,其中在马拉维,尼日尔和坦桑尼亚社区被分配到口服阿齐霉素或安慰剂的4一年两次质量分布。儿童,年仅12个月的年龄,参加和结果表明,全因死亡率为接受抗生素与安慰剂社区显著降低。 

“这是一个非常令人兴奋的,而且在许多方面,对于这样一个不足的人群非常令人惊讶的结果,说:”谢斯,谁是系统生物学的轨道四年级博士生 太阳城平台(cuimc) 。 “现在关键是要了解阿奇霉素是如何采取行动来提高生存在这样一个深刻的方式 - 来帮助干预的规模化,并帮助优化治疗方案,并尽量减少任何意想不到的后果。” 

研究人员将重点发展的阿奇霉素是如何重塑肠道微生物一种机械的理解,而这种改变微生物状态如何影响主机。抗生素的效果进行研究在空间和时间来了解扰动肠道生态系统和所得社区重新配置和重新组装,并且该信息将被用来预测和测试最佳给药策略。 

彼得·西姆斯博士
彼得·西姆斯博士

癌症研究基金会标志 已授予 彼得·模拟人生 博士,一个新兴领袖奖,并会支持他的工作推进的新用途单细胞RNA测序的发展脑癌的治疗方法。博士。 SIMS,在太阳城平台系统生物学助理教授,只是8个接收方就职授予之一,提供给有前途的年轻科学家的目的是在患癌症的风险预测,预防,检测和治疗基本上未满足的需求的项目。 

博士。 SIMS是早期贡献者大型单细胞RNA测序,这使得能够分析细胞数万同时从每个单独的小区获取成像和基因组数据的新兴领域。他将使用这种方法来改善胶质母细胞瘤(GBM),癌症的侵略性,侵入大脑,使完整切除困难的患者的衍生车型。换句话说,使得它极难在手术中从大脑中删除所有癌细胞。迄今为止,对于这种类型的攻击性脑肿瘤的药物治疗取得了有限的成功,部分原因是因为这些肿瘤的异质性。此外,目前病人的衍生车型为研究胶质母细胞瘤不能完全概括存在于肿瘤的肿瘤细胞的细胞多样性,所以这是非常具有挑战性的那些细胞进行分类,以便与工作药物疗法配合他们。 

的确,是有迫切需要更好地表征和理解GBM。博士。西姆斯曾与在几个脑肿瘤专家 赫伯特欧文综合癌症中心 包括DRS。彼得canoll,杰弗里布鲁斯,安东尼奥iavarone和Anna lasorella推进单细胞基因组的方法来表征这种疾病。在单细胞水平上处理这个问题可能造成对其优先考虑并确定具体的药物治疗,可能实际上是在减少这些肿瘤细胞工作的新的治疗方法的发展。最终的目标是达到治疗效果的更好的预测。