核心领袖: 彼得·模拟人生

为实现哥伦比亚中心癌症治疗系统(CAST)的科学目标是一项技术要求会获得高性价比的新锐分子分析,高通量筛选,并利用机器人技术和微流控芯片单细胞分析工具。分子谱核心(MPC)提供了利用的JP苏兹贝格哥伦比亚基因组中心的新一代测序和高通量筛选设备资源三个关键能力。

plateseq

plateseq是用于与基因组范围表达谱积分的高通量筛选的新的平台。它使得为每个廉价,低深度RNA测序以及在使用产生的屏幕相同的自动化的扰动屏幕。使用铸调控网络的建模方法癌症,plateseq数据的计算分析考虑先前推断的基因相互作用的优势,降低噪音,从而减少对通过深度测序跨屏基因表达谱活动的覆盖要求。

微流控

分子谱芯还提供了一个高度多路复用,微流体实施plateseq的产生表达谱在数百单电池并联连接。这个平台允许投研究者找出背后扰动异构反应的细胞表型。

单细胞全基因组测序

分子谱核心还开发了一个管道,它结合了全基因组扩增单细胞全基因组测序基于显微镜单细胞分离。单细胞基因组学允许铸调查人员,特别是在 项目2,以确定遗传改变共同出现或在癌症细胞的特异性亚群只发生。