太阳城平台基因组中心维护收集了大量小分子,shRNA的的,的siRNA和基因的筛选和分析的发展。那是在一个特定的屏幕使用的分子的精确的设定可以根据具体性质和实验的目标进行定制。

此外,我们的工作人员也有与教师密切接触 化学探针合成设施,共享资源,以协助设计和合成的干细胞相关研究项目新型小分子探针的研究人员。

分子的以下库可在哥伦比亚基因组中心。

小分子

太阳城平台基因组中心维护的几个小分子库,让研究人员非常广泛的兴趣扰动生物系统选项。

导致优化的化合物库(LOC)

引线优化化合物库包含通过消除处理拍摄10095种化合物,在实验室 布伦特斯托克韦尔,从超过300万的化合物从各种商业库(ASINEX,生命化学品,烯胺,timtec,interbioscreen和ChemBridge公司)的池。在LOC设有在药代动力学性质和支架多样性方面都可用最佳的化合物。

库化合物已被过滤的传统物理化学描述符,如五规则,可旋转的键数,拓扑极性表面,和合适的水溶性。也评价为化合物的反应性和毒性使用公开的并且基于来自先前的文库中筛选的经验而获得的数据在内部哥伦比亚基因组中心的预测因子。

各化合物表示通过化合物聚类识别的唯一的支架,消除重复和创建一组不同的潜在的先导分子。以提高打击对铅的比例,特别强调了消除被认为不适合进一步导致发展以及可能的化合物被非特异性作用的支架,如洗涤剂。

在LOC代表当前可从商业供应商的化合物池的最佳多样采样。

约翰霍普金斯大学临床化合物库(jhccl)

约翰·霍普金斯大学临床化合物库包含1600美国FDA和外国批准的药物在7个板。库被组装在携带5毫米股的药物384孔板格式。

光谱采集

通过microsource发现系统创建时, 光谱采集 包含来自其已知药物,实验生物活性剂,和纯天然产物文库2320种生物活性和结构上不同的化合物。

普雷斯蒂克化学库

普雷斯蒂克化学库 包含1200个的小分子,所有这些都是在美国FDA批准的药物。

的siRNA

太阳城平台基因组中心维护的各种 Dharmacon公司sigenome®smartpool® 的的siRNA库,包括:

  • 人类基因组
  • 人类的药物靶标
  • 人G蛋白偶联受体
  • 人类离子通道
  • 人类磷酸酶
  • 人体蛋白酶
  • 人类蛋白激酶”
  • 人泛素缀合的子集1到3
  • shRNA的

研究人员在太阳城平台具有对Sigma Aldrich公司使命的shRNA的集合独占访问。任务收集从派生 RNAi协会(TRC)基于在已经产生了人类全基因组lintiviral短发夹RNA(shRNA的)库用于测试人类和小鼠基因Broad研究所公共和私营部门的努力。

基因

精密lentiorfs集合 物(该rmo Scientific)是人全长表达就绪lintiviral开放阅读框(ORF)的文库使用来自完全测序orfeome协作集合基因内容生成。更多信息,请参阅 精密lentiorf技术手册.