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2017年9月28日

在部门年度务虚会表彰优秀青年调查

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海报获奖者系主任安德烈卡利法诺(右一),从左至右:塞巴斯蒂安weyn-vanhentenryck,昊运和锦州元

研究多样性和创新是在系统生物学的年度务虚的部门的关键主题。手持七重峰Tarrytown的18,纽约,撤退是由145位嘉宾出席,其中包括教师,学生,博士后,科研人员和部门客人的混合。一系列演讲展示在正在进行的合作项目 中心癌症治疗系统 (CAST),与会话沿教师对他们正在进行的研究,例如,在计算遗传学,复杂的预测方法与癌症相关的基因组学领域。全天活动还包括海报会议和竞争,突出才能的学生和研究人员的部门的游泳池。

系主任 安德烈卡利法诺 说,他希望的是年度务虚会给予每个人都有机会“上的各种不同的研究和各种方法目前在部门去反省。” 

教师评委评为海报设计比赛的三位获奖者,承认学生昊运和塞巴斯蒂安weyn-vanhentenryck和博士后研究员,锦州元的工作。

昊运,一个博士生 尼古拉斯·塔通蒂的 实验室中,看着靶向治疗中,使用的化学品通过具有特定分子靶的干扰阻止癌症的生长和转移的新兴治疗。如表皮生长因子受体抑制剂在癌症治疗中使用的电流剂通过低功效和高毒性对正常组织的限制。豪集中在G-蛋白偶联受体(GPCR),膜受体,这尚未在目标治疗中使用的最大家族。浩建的计算工作流程,以确定癌症治疗的GPCR,并在他的研究,结果表明预测的GPCR兼顾高疗效和毒性低的水平,提供癌症药物开发的新方向。

博士生 塞巴斯蒂安weyn-vanhentenryck 从第一次和共同作者慧娟锋 李朝林张 实验室大脑发育过程中检查信使RNA剪接调控。大脑发育需要高度协调的基因调控。信使RNA剪接(AS)是必须发育和时间控制调节中的一个层,但是发育剪接开关的精确定时和底层调节机制知之甚少。 weyn-vanhentenryck和他的团队使用的计算方法,通过在小鼠大脑发育的过程中神经细胞的剪接方式进行分类。他们预测RNA-蛋白质相互作用表明新星,rbfox,MBNL和PTBP可以以各种组合使用的蛋白以调节神经元剪接网络。该小组发现,特定类型的神经元曾与调节蛋白的独特组合,特别剪接模式。他们的研究结果提供新的见解如何剪接有助于细胞发育。

博士后研究科学家 彼得·模拟人生 实验室, 锦州元 提出了一种新技术,即范围-seq的,可扩展的,经济的技术,进行活细胞成像和大规模同一个体细胞的RNA测序。元和SIMS设计在基于阵列微孔平台,其分析数千并联单个细胞中实现范围-SEQ,使其能够检测数千每个细胞的基因,保持高表达谱纯度和链接光学表型和表达谱以高精确度相同的小区。当该技术在细胞内酯酶活性测定-的机构被施加通常用于测量细胞活力元和SIMS能够识别潜在的相关表达基因签名。在以后的工作,这种新技术可以适用于研究药物抗性的分子机制或动态蛋白表达模式与单个细胞的全基因组基因表达配置文件关联。