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Dr. Tuuli Lappalainen 科学 Study

插图以上的四种基因,如何知道可变基因是如何在正常人群中有助于发现候选致病基因在患者的示例性描绘。以上,顶端:塔利拉帕莱宁博士;底部:pejman穆罕默迪,博士学位。

对于罕见疾病的个体,得到一个诊断往往是一个漫长而复杂的奥德赛。在过去的几年中,这已经大大基因组测序,可以精确定位,打破的基因,并导致严重的疾病的突变改善。然而,这种方法仍是广大患者成功,很大程度上是因为我们无法读取的基因组,以确定破坏基因功能的所有突变。

在10月10日发表的一项新研究 科学 从研究人员 纽约基因组中心 , 太阳城平台 斯克里普斯研究所 提出了一个解决这个问题。建立一个新的计算方法与从RNA测序转录数据分析的基因组在一起时,它们现在可以识别基因,其中的遗传变异破坏患者的基因表达,改善罕见遗传疾病的诊断。

在这项研究中引入的新的方法,表达的变化或aneva的分析,首先需要从健康个体的较大的参考样品的等位基因特异性表达数据来了解有多少基因调节变异每个基因的港口在正常人群中。然后,使用aneva用量异常的测试,研究人员可以分析任何个人的转录组 - 比如一个病人 - 寻找基因的屈指可数他或她怀揣着相比有什么健康的人有一个非常大的作用的基因变异。通过应用该测试肌肉萎缩症和肌病患者队列,研究人员展示了他们的方法的性能和诊断其中的基因组和RNA分析以前的方法未能找到破基因另外的患者。

一个发展中果蝇胚胎的时间间隔。 (来源:卡洛斯·桑切斯HIGUERAS /hombría实验室/ CABD)

每一种动物,从蚂蚁到人,包含在DNA称为Hox基因它们的基因组片段。身体的建筑师,这些基因是人体的蓝图的饲养;他们决定胚胎是如何成长为成年人,包括在一个发展中的动物把它的头部,腿部和身体其他部位。科学家一直在寻找方法来破译Hox基因是如何创造这个身体图;一个关键的解码我们如何构建我们的身体。

现在一个国际研究小组从 太阳城平台 和西班牙国家研究委员会(CSIC)设在 大学帕伯罗·奥拉维德 在西班牙塞维利亚发现一个这样的关键:一,可以系统地识别每个同源异形基因在发育中的果实蝇所起的作用的方法。他们的研究结果,在最近报道 自然通讯 ,提供了一个新的前进道路为研究人员希望能够让这个过程是相等的部分混乱和精确的意识,那就是理解不仅增长和发展,而且衰老和疾病的关键。

“基因组,其中包含数千个基因和几百万的DNA字母,是有史以来最复杂的代码,说:”研究的共同资深作者 理查德·曼恩 博士,主要研究人员在哥伦比亚 莫蒂默湾祖克曼头脑大脑行为研究所 和一个教员在 系统生物学系 。 “破译这个代码已经被证明非常困难,因为进化三天打鱼两天写的,并开始在数亿年。今天的研究提供了一个重要开裂的代码,使我们比以往任何时候更接近了解Hox基因是如何建立一个健康的身体,或者这个过程如何被疾病破坏“。

阅读在完整的文章 朱克曼学院

Sagi Shaipra PHIPSTer 细胞 Paper
研究人员实现对时髦,它利用蛋白质结构信息来识别所有完全测序的人类感染性病毒的大约282000蛋白质 - 蛋白质相互作用(在所有1001)在硅片计算框架。这一形象突出,除了重新发现已知的生物,对时髦取得了一系列新成果,使细胞的电路和对感染人类的​​病毒行为生物学原理的以前不受重视宇宙的发现。 (DR的图像提供。鹭夏皮拉)

研究人员 太阳城平台 已经利用映射所有已知感染人类的​​病毒和它们感染细胞之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用的计算方法。该方法,用它产生的数据一起,催生了大量的信息对改善我们的病毒是如何操纵它们感染细胞并导致疾病的认识。其调查结果中,工作揭示了雌激素受体调节寨卡病毒(zikv)感染的作用,以及癌症与人类乳头状瘤病毒(HPV)之间的联系。

研究为首 鹭夏皮拉 博士,助理教授 系统生物学系 Department 的 Microbiology & Immunology 在太阳城平台 医生和外科医生学院瓦格洛斯 今天,出现在杂志上, 细胞 。博士。夏皮拉的合作者包括教授 巴里霍尼格 博士系统生物学和生物化学和分子生物物理学和 罗尔·拉巴丹 博士的系统生物学和生物医学信息学。 

蛋白质工程是创建在自然界从未见过的新的蛋白质相对年轻的领域。今天的蛋白工程师通常由作出小的修改编码的天然蛋白的基因创造合成蛋白质。各种合成蛋白质的范围从已改善的洗涤剂,这些会用来以百万计的人患有糖尿病的长效胰岛素去污的酶。

但对于蛋白工程师两大未解的挑战依然存在:需要加以遏制,以防止逃逸到其它生物体的编码合成的蛋白质的基因和基因需要抵抗变异随着时间的推移使蛋白质不会失去其功能。

通过合并两个基因成一个单一的DNA序列,太阳城平台合成生物学家已经创建了一个可以阻止人类工程蛋白扩散到野外,以及稳定的合成蛋白质,使他们不随时间变化的方法。工作,最近发表在 科学,是发达国家通过 哈里斯旺博士,助理教授 系统生物学,具有研究生, 托马斯·布拉泽久斯基 和博士后科学家, 幸浩我博士。 

在制定该方法中,研究人员通过在病毒重叠基因的启发。当两种不同的基因重叠,它们占据DNA的相同序列。但基因被读入,使得两种不同的蛋白质产生不同的帧。

在重叠基因,序列中的随机突变可能不影响一个基因,但它很可能是它会损害第二个基因。

“重叠基因基本上锁定在一个特定的DNA序列,我们认为我们可以利用这个想法合成生物学......十年前,我们没有足够的技术,将做到这一点,”博士说。旺。 “我们没有足够的序列数据库中作出明智的预测,我们没有办法合成长的DNA序列测试我们的预测。”

肠道微生物组由数百种不同的细菌,是一个复杂的社会和科学家解开一个挑战。一个具体的挑战是不同的微生物,这是不是均匀分布在整个肠道分布的空间分布。通过开发出一种新方法 实验室博士。哈里斯旺 应该帮助科学家找到并表征这些街区,这可能对微生物如何影响其主机的健康线索。

可以识别肠道微生物的所有物种的技术只有与该保留空间信息只能种类屈指可数应对均质的样品(如粪便),但方法的工作。

博士。王,系统生物学和助理教授 p在hology & cell biology和研究生 拉维谢斯 在里面 系统生物学系,测试新技术与谁从低脂肪切换到高脂肪食谱的老鼠。饮食是众所周知的改变特定细菌的丰度在几天内肠道,但新技术也透露,开关造成微生物的街区批发变化。

“细菌的特定区域与饮食开关被完全丧失,”谢斯说。 “这是令人兴奋的我们,它将给我们的线索,以了解这种变化是如何发生的,以及如何变化可能会影响健康。”

阅读全文 文章 在里面 cuimc编辑部

研究,题为 “在肠道微生物生物地理学的空间宏基因组特征,” 是7月公布的22 自然生物技术.

 

太阳城平台研究人员陈赢得主动扎克伯格赠款,以加快人体的细胞发展蓝图的发展。

两个开创性的研究项目,促进人体细胞图谱,美国太阳城平台的科学家的任务是在免疫系统中的映射完整细胞和人体脊椎。全球努力的目标是识别和定义人体的每一个细胞类型和创建的地图集合了导航人类健康和疾病的细胞基础。

彼得·模拟人生, PhD
彼得·西姆斯博士,系统生物学助理教授

哥伦比亚小组,其中包括从所述共主要调查 系统生物学系 DRS。 彼得·模拟人生 罗尔·拉巴丹 ,有38个相互协作的科学团队开展中 陈扎克伯格主动的(CZI)种子网络 今天宣布的人类细胞图谱项目。为期三年的项目,由种子网络共收到获奖中资$ 6800万是正在组建的专业知识在学,计算生物学,软件工程和医学支持的不断进步协作组 人体细胞图谱 .

调查免疫系统+老化

博士。 SIMS,一个国际的一部分 球队 包括亲密合作者博士。 唐娜·法伯 外科 ,是结合单细胞测序技术,数据分析和免疫学的专业知识,以便更好地了解免疫系统老化,并获得新的见解人类疾病是如何发生的。 

Chaolin Zhang
李朝林Zhang博士,系统生物学副教授

在博士研究人员的一项最新研究。李朝林张 实验室 在哥伦比亚 系统生物学系 详细介绍了模型如何RNA结合蛋白(限制性商业惯例)识别靶RNA转录特定网站,精确和准确新颖的计算方法。研究人员的研究结果包括:全新的图案(RNA序列模式)的识别,以及他们在复杂的RNA调控的研究有助于我们对疾病和状况的分子基础的认识,并在路上,可以在靶向治疗的发展援助。 

研究为首 博士。张,系统生物学的副教授,拥有资深的合着者 苏樱宝博士,和 慧娟锋博士,今天出现在 分子细胞

RNA具有传统上被认为仅仅是“信使”,从DNA转移遗传信息到最终进行的细胞功能的蛋白质。然而,现在越来越多地认识到,RNA可以被紧密调节,以控制基因表达和蛋白质的多样性产品。 RNA结合蛋白(限制性商业惯例)是在这样的规定的中心,与在许多细胞过程的重要作用,包括细胞的功能,传输和定位。在全基因组范围获得限制性商业惯例的结合特异性的机械见解有助于推进我们的基因调控的认识。

“RNA结合蛋白基因表达的关键,”博士说。锋,在张的实验室研究和博士后研究科学家的合着者。 “RNA受到严格管制,而当这种调节变为可能发生错误,不稳定性或疾病。”  

博士。安德烈卡利法诺坐下与AACR生物学技术。视频:生物学技术的礼貌。

在癌症研究协会(AACR)的2019年会上, 博士。安德烈卡利法诺 坐下来与生物学技术对新闻系统生物学领域及其在癌症研究和精密医学上的影响的概述。博士。卡利法诺是系统生物学,其专长是开发创新性,系统性的方法来识别导致癌症进展和耐药性在单细胞水平出现的分子因素的快速增长领域的开创性研究。通过培训物理学家,博士。卡利法诺是化学和系统生物学的克莱德和海伦吴教授,创始主席 系统生物学系太阳城平台,主任 太阳城平台基因组中心 并在一个项目负责人 赫伯特欧文综合癌症中心.

视频访谈 是该系列的一部分,由technqiue背后 生物技术: 新闻。 

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系统生物学研究生布赖恩·吉博士

布赖恩纪,大抽奖系统生物学从他的激情的词根运用定量方法理解生物学。而在威斯康星 - 麦迪逊大学的本科,姬研究核工程和对他铲球科学问题的方式培训学分:创造性,并作为解决问题的能手。 

“还有就是问问题并列明回答这个问题没有一个正确的做法,并认为自由是什么使科学的乐趣对我来说,”他说。 

吉门下 博士。丹尼斯vitkup 在里面 vitkup实验室 并完成了系统生物学的论文答辩在2018年也是一个MD学生在哥伦比亚的秋天 医生和外科医生学院瓦格洛斯 姬被吸引到哥伦比亚,因为之间的密切相互影响 系统生物学系 和太阳城平台。 “最终,”他说,“坐在数学,生物学和医学之间的交叉机会太好错过。”

辛弃疾的博士工作集中在理解人类肠道菌群的时空动态。他开发了利用高通量测序数据的可用性的增加,以更好地理解和跨越时间和空间的精确量化人类肠道菌群的变异模式几个框架。他的工作表明,表征细菌丰度动态变化,变化在我们的肠道是理解如何将这些生态系统的功能和高度连接到多个因素,如主机饮食,旅游和饮食的关键。 

姬也度过了他攻读博士学位在不同的环境条件下癌细胞生长的局限性的一部分。他相信太阳城平台使他面临各种各样的研究课题。 

菲利斯thangaraj
菲利斯thangaraj,MD /博士研究生(t在onetti实验室)

来自太阳城平台的抱负医师科学家 医生和外科医生学院瓦格洛斯 提出了太阳城平台4月25日第14届年度MD-博士生研究讨论他们的研究海报他们的研究深入探讨了一系列主题,包括阿尔茨海默病,中风,和干细胞。该活动包括由她自己的职业发展道路作为一名医生,科学家的校友嘉宾演讲,并通过谁目前在大学工作的MD-博士学位校友判断海报会议达到高潮。系统生物系的 菲利斯thangaraj,一个MD /博士研究生在尼古拉斯·塔通蒂 实验室 ,被评为在事件5名海报获奖者之一。 

她提出了太阳城平台将机器学习方法,以表型急性缺血性卒中患者的电子健康记录的工作。在队列调查研究,有必要确定一个准确和有效的方式了大量的题材,但往往这需要病历的耗时的人工审核。 

“我们采用机器学习方法,以数据病人的电子健康档案内开发出高通量的方式来定义研究队列,”解释thangaraj。 “我们的测试案例是在急性缺血性中风。我们提取出所需的最小数据处理分类那些谁曾有过中风的人的医疗记录中的线索。在一个单独的队列,英国生物库,我们可以用我们的模型来确定患者的自我报告的中风,但在他们的医疗数据没有提及有65倍以上的患者随机选择更好的精确度。”虽然中风是测试用例在这个特殊的工作,她解释说,他们的工作流程可以适用于识别患者其他疾病的同伙,特别是当数据集已经丢失的数据。 

该 Korem Lab

在厌氧hadrus检测到的结构变化,这是在人口(顶部)的〜40%删除,并且具有较高的疾病风险相关的一个。基因在此区域(底部)代码的复合肌醇代谢 - 丁酸生产途径,潜在地与额外的能量供给微生物而供给用丁主机,先前显示具有积极的代谢和抗炎作用。 (来源:korem实验室)

我们的肠道微生物已被证实与一切从肥胖和糖尿病心脏疾病,甚至神经系统疾病和癌症。近年来,研究人员一直在整理通过填充微生物多菌种,要求其人可以在特定的紊乱有关。但一纸近期发表于 性质 解决新的问题:“如果有什么相同的微生物是在不同的人有什么不同?”通过研究共同领导 博士。 TAL korem ,助理教授 系统生物学 和芯教员在 程序数学基因组学 太阳城平台

已经早就知道,微生物的基因组不从出生固定的,因为我们是。他们能够失去他们的一些基因,交换基因与其他微生物,或获得从他们的环境新的问题。因此,看似相同的细菌的基因组的详细比较将揭示发生在一个基因组,而不是其他,或者可能出现只是在一个一次序列和多次超过在其他DNA序列。这些差异被称为结构变异。结构变异 - 即使是微小的 - 可以转化为在微生物与人类宿主相互作用的方式的巨大差异。变体可能是良性的存在和病原性之间的差异,也可能给细菌对抗生素的抗性。

博士。罗尔·拉巴丹正在领导一个全球性的研究项目从胰腺癌集体查明胰腺癌的高危因素,新批的一部分。 (站起来,癌症提供)

研究人员组成的全球团队领导的理论物理学家 罗尔·拉巴丹博士,教授 系统生物学 在哥伦比亚 医生和外科医生的瓦格洛斯学校 努里亚mal在s博士,遗传和分子流行病学组西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的负责人,正在努力制定一个全面的计算框架,将确定为胰腺癌的高危因素。  

一个新的为期两年的武装,$ 1百万 发放 来自 胰腺癌集体,球队有意攻击多个学科的基因组学,数学和胰腺癌研药,以提供研究,可能在胰腺癌的高危人群识别基因,环境和免疫因素的综合,计算方法。需要成因的更深层次的理解这种致死性疾病逼人,胰腺癌预计将成为未来十年内癌症相关死亡的第二大原因。 

Rabadan-led Team for 胰腺癌集体
DRS。罗尔·拉巴丹纽丽mal在s

太阳城平台的研究人员已经了解到为什么有些胶质母细胞瘤,脑肿瘤,响应的最常见的类型,以免疫治疗。调查结果, 报道 由cuimc编辑部,可以帮助确定患者谁最有可能受益于治疗与免疫治疗药物,并导致更广泛的有效治疗方法的发展。

研究为首 罗尔·拉巴丹博士,教授 系统生物学 和生物医学信息学的 太阳城平台瓦格洛斯内科医生和外科医生学院赫伯特欧文综合癌症中心,是在杂志上在线发表 自然医学

不到1 10例胶质母细胞瘤响应免疫治疗,已经显示在过去的几年里显着的成功治疗各种侵袭性癌症的。但一直没有办法提前知道哪个胶质母细胞瘤患者会作出回应。像许多其他癌,神经胶质瘤能防止免疫系统攻击癌细胞。癌症有时把免疫系统的刹车作用于蛋白质称为PD-1。称为PD-1抑制剂的药物的免疫治疗被设计成释放那些制动器,发动免疫系统。给予PD-1抑制剂在其他癌症的成功,医生们希望,免疫治疗药物将有助于患者的胶质母细胞瘤。 

理解为什么只有少数这些肿瘤的免疫治疗药物,医生回应。 rabadan的团队采取了在肿瘤微环境,包括肿瘤本身和所有支持它,在66名胶质母细胞瘤患者治疗前,用PD-1抑制剂(nivolumab或pembrolizumab)处理后,细胞的全面审视。其中,17不得不六个月或更长时间的药物反应。

无反应的肿瘤在一个叫做PTEN的基因,从而导致更高水平的巨噬细胞,免疫细胞通常帮助人体抵抗细菌等入侵者有更多的突变。但在胶质母细胞瘤,巨噬细胞释放出许多的促进存活和肿瘤细胞的扩散生长因子。

 

PCF 挑战奖 PIs
在PCF挑战奖授予首席调查员,从左至右依次为:安德烈卡利法诺,迈克尔沉和查尔斯·德雷克。

在前列腺癌太阳城平台的专家将带领该测试的个性化癌症治疗的新方法新的团队的研究项目。 

在为期两年的项目,由$ 1百万资助 挑战奖 来自 前列腺癌基金会(PCF) ,结合尖端技术,包括用于靶向药物治疗,单细胞RNA测序和新颖的癌症免疫疗法的计算方法。合并的方法是一个证明的概念临床试验的患者致死转移性前列腺癌的后面。  

带来专家一起从一些相关领域的PCF挑战奖励基金项目,形成一个团队专注于建立创新的,有效的治疗晚期前列腺癌。作为太阳城平台的赠款的一部分,新的临床试验将在该 詹姆斯学家彼得斯退伍军人医疗中心 (也称为布朗克斯VA),的伙伴 太阳城平台(cuimc) 纽约长老会 .

PCF是公认的前列腺癌研究的主要慈善组织。对于球队在哥伦比亚 赫伯特欧文综合癌症中心(hiccc ),接收来自该基金会是一个挑战奖不仅仅是一个令人兴奋的成就更多。它强调cuimc继续致力于加强和扩大其专业知识在前列腺癌的研究和关心通过教师招聘的投资,对bolstering基础科学研究和集中在疾病与PCF直接参与临床试验增强重点。 

2018年12月4日

创新引擎:医学研究

研究人员在 Vagelos College 的 Physician & Surgeons 被重写科学调查的过程中,意图太阳城平台加快发现的过程,这将有助于癌症患者,老年痴呆症,糖尿病和其他棘手的诊断。

在癌症, 安德烈卡利法诺博士,克莱德和化学生物学和系统生物学的海伦吴教授和椅子 系统生物学系,决定把癌症治疗理论发挥得淋漓尽致。研究在追求个性化肿瘤的第一波集中在嵌入式个别肿瘤内的线索。解码核酸特定的患者所患癌症的DNA中出了错,还是让思维去,以确定专门面向特定的突变处理。

这是一个很好的理论博士说。卡利法诺在 文章,但调查人员仍然有很多工作要做之前,绝大多数的癌症屈服于这种做法。 “也许只有25%的患者有可能被定义为可操作的突变,”他说。

超过十年,博士。卡利法诺拥护可能被认为围绕癌症突变运行的端部,而不是专注于识别和阻断正常的网络蛋白质-称为主调节-劫持错乱DNA刺激肿瘤形成和维持肿瘤生长。防止这些蛋白质代表癌突变的发送信号,以及癌症本身尖叫停止。

沉宇峰 episcore

rbfox2的表观基因组图谱,haploinsufficient基因最近被确定为先天性心脏疾病的风险基因。每个小方块表示周围转录起始位点(TSSS)和颜色的深浅的100bp区域反映所述组蛋白标记信号的在正常条件下的组织的强度。 rbfox2具有血液样品中的大的膨胀活性组蛋白标记(H3K4me3的和h3k9ac),尤其是在心脏和上皮组织(紫色和灰色的行),和组织特异性抑制标志(的H3K27me3)(信用:沉实验室)。

发育障碍,如先天性心脏疾病和孤独症的遗传,是非常复杂的。大约有500到1000个基因的风险可能导致这些疾病的,到今天为止,大约只有几十个已经确定。科学家们已经憋足了努力开发的计算方法,以解决准确地标识在正在进行的遗传研究遗传风险因素的挑战,以及这些工具的可用性将大大有助于研究人员获得对这些疾病的根源更深的了解。 

专注于单倍剂量不足,发育障碍的遗传风险的关键生物机制, 沉宇峰 博士和他的 实验室 已经开发了能够使研究人员发现在这些疾病的新风险基因一种新的计算方法。其核心思想是haploinsufficient基因的表达必须正常发育过程中精确调节,这种调节可以在基因组调控元件的不同的模式来体现。使用来自NIH路线图表观基因组项目的数据,他们表现出有一定的组蛋白标记和已知的haploinsufficient基因密切相关。然后根据监督的机器学习算法,他们开发出一种新方法,他们称之为 episcore 来预测从表示宽范围的组织和细胞类型的表观数据单倍剂量不足。最后,他们证明episcore的先天性心脏疾病和智力残疾的研究新的危险变异的识别工具。  

从太阳城平台的一个研究小组已经收到了 2018 PCF挑战奖 从前列腺癌基金会(PCF),进入前列腺癌的研究。跨学科的团队在哥伦比亚包括系统生物学的著名专家,从太阳城平台的癌症研究和医学 系统生物学系 和 赫伯特欧文综合癌症中心(hiccc)

今天宣布, PCF 被授予超过550万的资金$一共有六支球队最高的潜力进行研究加快新的和改进的治疗晚期前列腺癌。 PCF是专门致力于资助前列腺癌研究的最大的非政府组织之一,其每年的挑战奖励在科学和医学领域令人垂涎。 

在美国,前列腺癌是最常见的非皮肤癌,而1,每9人在美国的将被诊断出患有这种疾病在他的一生。迄今为止,治疗前列腺癌的最进取的形式表示的临床挑战。具有抗雄激素药物,这是护理的标准晚期转移性前列腺癌的部位治疗失败后,只有少数目前的治疗选择仍然和病人生存的影响是有限的。事实上,该领域需要创新的重大,乱的盒方案来的新疗法,以打击晚期前列腺癌。 

 

DSB Retre在
丹尼斯vitkup实验室的成员,从1至r:konstatine tchourine,德国Pl在a的和Jon昌(信用:桑德拉squarcia); 照片库 撤退。

创新的研究项目,在系统生物学的年度务虚会,举行10月5日的部门河谷强调,在波山的公共花园和文化中心,纽约。撤退,由160教师,员工,博士后科学家,学生和嘉宾出席,还提供了一个机会,让年轻的研究者海报比赛中展示自己的作品。 

安德烈卡利法诺 ,博士,系主任,开了一天的会议与致欢迎辞,作为撤退还担任由美国国家癌症研究所的太阳城平台网站的访问 中心为癌症治疗剂的系统(浇铸) 。投,联合导演DRS。卡利法诺和 巴里霍尼格 ,该部门的副主席,成立于2016年在美国国立癌症研究所的癌症系统生物学联盟(CSBC)的主要中心之一。背后CSBC主动权在很大程度上接地的临床和基础癌症研究人员用物理的科学家,工程师,数学家和计算机科学家谁合作,从一个新的解决癌症生物学中的重大问题的创新汇集跨学科的团队外的开箱点看法。 

 

安德烈卡利法诺
安德烈卡利法诺,博士。

安德烈卡利法诺 ,博士,在系统生物学领域的先驱和创始主席 系统生物学系 太阳城平台(cuimc),已当选为 医学国家科学院(NAM) 。会员在越南被认为是健康和医学领域的最高荣誉之一,并认识谁已经证明优秀的专业成绩和承诺服务的个人。  

通过培训物理学家,博士。卡利法诺采取新颖,系统的方法,以确定导致癌症进展和耐药性的在单细胞水平的出现的分子因素。从只注重于基因突变,博士指导有关癌症研究的谈话了。卡利法诺将检查确定癌细胞行为的复杂性和肿瘤特异性分子相互作用网络。使用信息论的方法,这些网络的分析可以精确地查明主调节蛋白是机理上负责支持肿瘤发生和用于实现肿瘤细胞稳态。博士。卡利法诺和他的实验室已经表明,主监管机构代表的重要推动力和肿瘤相关性,尽管事实上它们很少发生突变或差异化表达,从而确立了其作为一个真正的类新的治疗靶点。

尖毛虫

尖毛虫。 (来源:鲍勃·哈默史密斯)

劳拉兰德韦伯博士,喜欢挑战。所以一点也不奇怪,她已经建立了一个科学的职业生涯揭开其生物复杂称为独特的单细胞生物的方法及理由。  

进化生物学家,他的工作处在遗传学和分子生物学,DR的接口。兰德韦伯,为近20年来,一直专注很多她的研究上 尖毛虫trifallax ,微生物有机体是普遍在池塘,饲料对藻类和具有高度复杂的基因组结构,使其成为有吸引力的,虽然具有挑战性的,模式生物研究。相比于人,用含有一些25,000个基因46条染色体, 尖毛虫 已知包含成千上万的染色体,在16000微小的“nanochromosomes”看球。但它不仅是复杂的染色体的绝对数量,但这些个体的染色体所携带的信息进行加扰,像信息压缩和发展的过程中 尖毛虫 必须解扰此信息,以便它可以转化为RNA和蛋白质。

“DNA可翻转和倒 尖毛虫 和细胞机制实际上是知道如何恢复秩序,”博士说。兰德韦伯。 “因此,这对了解基因组的完整性和基因组的完整性的维护和建立这种美妙的典范。” 

更令人费解的,细胞分裂, 尖毛虫 无性繁殖,当它想生产更多的数量,而且再现性时,它需要重建它的基因组。它也有“清理”其基因组这样说话的能力,消除几乎所有的非编码DNA,或所谓的垃圾DNA的。太多的为什么 尖毛虫 提出这样一个复杂的基因组景观仍然是一个谜,和博士。兰德韦伯,在这个单细胞原生生物的权威专家,对潜在的发现,完全开放的领域是什么让她大呼过瘾。 

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